Guerra das Galáxias

A história começa em 1999: uma nave alienígena gigante pousa na Ilha South Atalia. A humanidade continua a tentar reconstruir esta maravilha, mas os conflitos políticos centrados em torno de Macross - juntamente com propostas para um governo mundial - resultam numa guerra global. Após 10 anos, as 'Guerras de Unificação' finalmente terminaram, o novo governo das Nações Unidas está no poder, com o Espaço da ONU como seu braço militar. Estamos em 2009: o trabalho no Macross está concluído. No dia da cerimônia de lançamento, seu canhão principal dispara sozinho, destruindo uma espaçonave alienígena em órbita. Esta ação automática marca o início da guerra entre os humanos e os Zentraedi, uma raça de guerreiros humanóides de tamanho gigantesco.

O piloto aéreo e piloto acrobático Hikaru Ichijo e seu 'sempai' (mentor) Major Roy Fokker tentam uma ousada missão de resgate quando a Ilha South Atalia é invadida e bombardeada pelas forças Zentradi. Hikaru tem seu primeiro encontro com Lynn Minmay, uma jovem garçonete, enquanto os mechas Zentradi começam a invadir a cidade. Enquanto isso, o Capitão Bruno J. Global, a Tenente Misa Hayase, a Operadora da Ponte Claudia LaSalle e a tripulação do Macross tentam lançar o navio pela primeira vez.

Com Hikaru ainda se recuperando dos horrores que testemunhou em primeira mão de ambos os lados, os eventos pioram quando o sistema de dobramento espacial do Macross (uma tecnologia de viagem mais rápida que a luz) teletransporta ele e a cidade na Ilha Atalia do Sul para a borda do sistema Solar e na frente de Plutão.

Com os sistemas dobrados desaparecidos, o Capitão Global e sua tripulação percebem que o Macross deve fazer uma longa jornada de volta à Terra. Os civis da Ilha Atalia do Sul - junto com suas lojas e casas - são trazidos para o navio. Enquanto isso, Hikaru e Minmay estão presos dentro dos limites do Macross. Hikaru aprende muito sobre Minmay e inicia uma nova amizade com ela.

O comandante Zentradi Britai Kridanik e seu arquivista, Exsedol Folmo, começam a suspeitar que os humanos (ou 'miclones') são a 'Protocultura' há muito perdida e enviam ondas de ataque para testar sua teoria. Durante um ataque Zentradi, Global ordena que o Macross se "reconfigure" para o modo de combate para afastá-los. No entanto, a medida revela-se desastrosa para os civis e a infra-estrutura inocentes. Roy e Minmay convencem Hikaru a se juntar à frota Spacy da ONU no Macross para que ele pudesse continuar voando.

Usando uma anomalia defensiva deixada para trás após o desaparecimento dos sistemas dobrados e dos anéis de Saturno para esconder os Macross, Misa e Claudia elaboram uma nova estratégia de ataque contra os Zentradi.

Após alguns meses de luta, o Macross chega a Marte. Detectando uma base abandonada na superfície do planeta, a tripulação pousa a nave para reunir os suprimentos necessários. Quamzin Kravshera, um comandante Zentradi brilhante, mas instável, ataca Macross. Enquanto isso, Misa pede permissão para investigar um sinal de emergência vindo da base.

Enquanto Minmay comemora seu aniversário, Hikaru começa a se perguntar sobre seu relacionamento com Minmay e os sentimentos emergentes por Misa. Hikaru é promovido e tem Maximilian Jenius e Hayao Kakizaki designados como seus alas. Quamzin lança outro ataque contra Macross enquanto Hikaru se pergunta se celebrará o aniversário de Minmay a tempo.