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Criaturas bizarras conhecidas como “Desconhecidas” aparecem na costa da Baía de Tóquio. Defender-se deles é a missão de estudantes do ensino médio em Tóquio, Kanagawa e Chiba que possuem um poder sobrenatural conhecido como “Mundo”. Entre todos eles, o diretor da escola de Tóquio, Ichiya Suzaku, derrota Unknown com um poder particularmente avassalador, mas o subchefe de Tóquio, Canaria Utara, observa sua falta de trabalho em equipe com uma expressão preocupada.

Rumores circulam entre os estudantes que consertam a Aqua Line meio destruída de que um Desconhecido apareceu na área. Os representantes de cada cidade se dividem em duas equipes para investigar, e Suzaku acaba formando uma equipe com Hotaru e também com Kasumi, uma de suas pessoas menos favoritas.

Alguns dos alunos estão prestes a ser transferidos para um local mais seguro, e Ichiya falta à patrulha para visitar um desses alunos no hospital. Na opinião de Ichiya, todos os alunos transferidos são “amadores ineptos”. Enquanto isso, na ausência de Ichiya, um novo tipo colossalmente enorme de Desconhecido aparece.

Canário foi ferido na batalha contra o gigante Desconhecido, deixando Suzaku em uma situação desesperadora. Depois de ser salvo pelas forças de Chiba e Kanagawa e bater em retirada, Suzaku é chamado pela Administração para assumir a responsabilidade de agir por conta própria, mas ele implora por uma chance de terminar a batalha com a ajuda de Chiba e Kanagawa.

As vítimas causadas pelo ataque repentino do Desconhecido são tão graves que os estudantes de cada cidade não conseguem esconder o choque. Suzaku perde a confiança e a vontade de lutar, então Maihime se apresenta para atuar como líder de Tóquio. Maihime é forte e encorajadora quando está diante dos estudantes de Tóquio, mas...

Hotaru se envolve em uma batalha com um novo tipo de Desconhecido na zona de proibição de entrada, enquanto Suzaku trava uma batalha desesperada em Umihotaru, para onde a equipe de Chiba o levou. Ao mesmo tempo, um número sem precedentes de Desconhecidos aparece no céu acima de Tóquio. Diante da calamidade que se abateu sobre eles, Maihime carrega a esperança do mundo sobre seus próprios ombros.

Hotaru corre em direção a Tóquio, determinada a cumprir sua promessa de nunca mais deixar Maihime esperando. Enquanto isso, Maihime está cada vez mais exausta à medida que incontáveis ​​Desconhecidos a atacam. Só então, um Desconhecido único que Maihime determina ser seu chefe aparece.

Após as pesadas perdas sofridas pelo campo de Kanagawa, o Diretor Médico Okuni sugere retirar a linha de defesa para priorizar a proteção do continente japonês. Mas ela insiste que isso exigiria a transferência de Asuha, seu ativo de batalha mais forte, para o interior, e Kasumi não está disposto a deixar sua irmã ir tão facilmente. Quando Okuni responde à recusa de Kasumi convidando-o para uma conversa privada, ele assume que o objetivo dela é persuadi-lo a mudar de ideia, mas o verdadeiro objetivo de Okuni está em outro lugar...