RahXephon

Em Tóquio Júpiter, um garoto de 17 anos, chamado Ayato, está vivendo uma vida normal até que Tóquio Júpiter é atacado. Quando Ayato é salvo por Haruka, Ayato quebra um ovo que libera uma estrutura, conhecida como RahXephon, para lutar contra Mu.

RahXephon é despertado por Mishima Reika, ele ajuda lutando contra o D-1. Ayato acordou no hospital esquecendo o que aconteceu. Sua mãe finge não saber do que ele falou. Quando o D-1 estava se recuperando no laboratório, Ayato conheceu Haruka para saber a verdade, Haruka queria voltar ao mundo real, mas Mishima convocou RahXephon. RahXephon destruiu o D-1, descobriu que sua mãe tem sangue azul e foi para o mundo real passando pela barreira. (Sipnose veio de www.animeinfo.com)

De repente, Ayato fica surpreso ao ver sua mãe e dois de seus Dolems atacando. Ayato deixa Tóquio Júpiter, e um dos Dolems mata a mãe de Ayato, Mishima. Ayato, mata os Dolems e deixa Tóquio Júpiter. Enquanto isso, Haruka se junta a uma organização chamada Terra.

Ayato e Haruka agora chegam à cidade de Litya, junto com RahXephon, e agora Ayato e RahXephon estão sendo pesquisados, enquanto Ayato encontra Quon. Enquanto isso, Haruko é confrontado por Elvy, o único outro sobrevivente da Batalha em Tóquio Júpiter. Durante o teste, Ayato é considerado um Murian e é preso por ordem do Rei Kunugi. E então Litya é atacada por um Dolem. E Ayato deve salvar Terra do Dolem. Depois de eliminar o Dolem, Ayato entrega o Rahxephon para a Terra, onde ele pode ser cuidado pelo Dr.

Ayato é testado e considerado normal, sem o símbolo em seu torso, Quon também tem um. Enquanto Ayato conhece Soyoko, uma colega de trabalho, descobre que ele irá morar com Haruko e sua irmã Megumi, e seu tio Rikudo. Enquanto isso, Itsuki descobre que Quon é sua irmã. Quando Ayato está desfazendo as malas, ele encontra Buchi, que Quon embala para ele. E depois do jantar, Rikudo dá uma placa com o nome de Ayato.

Há 14 anos apareceu um Dolem. Agora o mesmo dolem está de volta e matando pessoas na Austrália. Kim Hotal recebe uma frase de efeito não autorizada devido ao fato de que Dolems usa esses sons para seus padrões de ataque! Agora, Terra deve esperar o Dolem aparecer e Ayato deve estar pronto para atacar. E quando isso acontecer, Ayato pode vencer? Ayato sai vencedor!

Watari e Kunugi estão voltando para Nirai Kanai, com um repórter da Yamato Communications, Futagami. Ao chegar à Terra está o Esquadrão Alpha, que se junta a Elvy para tomar o lugar de seus colegas mortos/feridos. Enquanto isso, Futagami vai até a casa de Rikudo, em busca de informações para Ayato. E quando Alpha Squad e RahXephon atacam um Dolem gigante, ele libera dolems menores. E Ayato deve derrotá-lo e o faz.

Itsuki encontra uma pedra enquanto examina o Dolem que foi derrotado no episódio anterior. Itsuki pega aquela pedra e dá de presente para Sayoko, no Natal. Depois, ele vai à praia e convida Ayato, Megu, Haruka e os demais para uma festa de véspera de Natal. E começa a nevar. Enquanto Megu e Kim fazem compras, Megu fala sobre Haruka, enquanto Haruka dá luvas a Ayato. E um Dolem parece congelar tudo. E RahXephon e Ayato devem derrotá-lo, mas há um problema, Sayoko faz parte disso. E cabe a Ayato salvar o Natal para Nirai Kanai. Quando fica em dúvida, Ayato pensa em Haruka e nas luvas que ele deu a ela, e salva o dia. Enredo B: Quon fica na cama debaixo do cobertor, porque ela odeia neve.